find hogeDir -type f|wc -l ファイル名のパターンを指定するときは find hogeDir -type f -name "*.fuga"|wc -l とか。

viで[dos]と表示された場合、shellスクリプトが正常に動作しない。 dos2unix コマンドで改行コードを変換します。 ちなみにその逆の変換(UNIXスタイル→DOSスタイル)は、unix2dosです。